ヒガンバナの白い花の別名だが、これも三倍体で種子はできないとのこと。牧野富太郎博士は、シロバナマンジュシャゲは、黄色いショウキズイセンとヒガンバナの交雑種であると断定したが、両者とも三倍体であるのに交雑種ができるのはおかしい。近年の遺伝子解析により、コヒガンバナ（ヒガンバナの２倍体）と、コヒガンバナの祖先において、突然変異で出現したショウキズイセン（２倍体）との交雑種であると認定された。すなわち、ヒガンバナ（３倍体）の原産地において、コヒガンバナ（２倍体）が当然自生するが、このコヒガンバナは古い時代に突然変異でショウキズイセンを生み出し、後世にショウキズイセンとコヒガンバナの交雑でシロバナマンジュシャゲが生まれたということで、いわば近親交配である。コヒガンバナは２倍体なので種子をつけるが、花径に花はせいぜい４つしかつけない。ヒガンバナ（３倍体）は花を６つ付けるが種子はつけない。ゆえに、花が多くて美しく、種子をつけないため球根の発達が良いことから、ヒガンバナ（３倍体）が全国にひろまった可能性がある。